| Aptamer ID | Aptamer descriptor | Target chemistry | Target name | Affinity | Binding Conditions/Buffer | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Apta_1061 | B03 | Protein | B2MG_HUMAN | 36.7 nM | Ammonium bicarbonate buffer (50 mM, pH 8.5) containing 500 mM NaCl | 32631049 |
| Aptamer Sequence: | TATTTATTGAATGCTGTAATTTCGCCACGCGAAAGTAGG |
| The optimal secondary structure in dot-bracket notation: | .............(((...((((((...)))))).))). |
| The centroid secondary structure in dot-bracket notation: | ...................((((((...))))))..... |
| Type | Detail | Type | Detail |
|---|---|---|---|
| Aptamer ID | Apta_1061 | Description | B03 |
| Aptamer chemistry | DNA | Length | 39 nt |
| GC content | 38.5% | Molecular weight | 12,035.77 Da |
| Molarity of 1 μg/μl solution | 83.09 μM | Number of G-quadruplexes | No QGRS found |
| G-Score | N/A | Function | Target detection |
| Sequence | TATTTATTGAATGCTGTAATTTCGCCACGCGAAAGTAGG | ||
| Applications | Detecting Mb in human serum and distinguishing acute myocardial infarction patients from healthy individuals | ||
| Type | Detail | Type | Detail |
|---|---|---|---|
| Uniprot ID | P61769 | Protein name | Beta-2-microglobulin [Cleaved into: Beta-2-microglobulin form pI 5.3] |
| Gene name(s) | B2M CDABP0092 HDCMA22P | Organism | Beta-2-microglobulin [Cleaved into: Beta-2-microglobulin form pI 5.3] |
| Status | reviewed in uniprot database | Length | 119 |
| Mass | 13,715 | Activity regulation | N/A |
| Involvement in disease | Immunodeficiency 43 (IMD43) | Catalytic activity | N/A |
| PDB ID(s) | 1A1M;1A1N;1A1O;1A6Z;1A9B;1A9E;1AGB;1AGC;1AGD;1AGE;1AGF;1AKJ;1AO7;1B0G;1B0R;1BD2;1C16;1CE6;1CG9;1DE4;1DUY;1DUZ;1E27;1E28;1EEY;1EEZ;1EFX;1EXU;1GZP;1GZQ;1HHG;1HHH;1HHI;1HHJ;1HHK;1HLA;1HSA;1HSB;1I1F;1I1Y;1I4F;1I7R;1I7T;1I7U;1IM3;1IM9;1JF1;1JGD;1JGE;1JHT;1JNJ;1K5N;1KPR;1KTL;1LDS;1LP9;1M05;1M6O;1MHE;1MI5;1N2R;1OF2;1OGA;1OGT;1ONQ;1P7Q;1PY4;1Q94;1QEW;1QLF;1QQD;1QR1;1QRN;1QSE;1QSF;1QVO;1R3H;1S8D;1S9W;1S9X;1S9Y;1SYS;1SYV;1T1W;1T1X;1T1Y;1T1Z;1T20;1T21;1T22;1TMC;1TVB;1TVH;1UQS;1UXS;1UXW;1VGK;1W0V;1W0W;1W72;1X7Q;1XH3;1XR8;1XR9;1XZ0;1YDP;1YPZ;1ZHK;1ZHL;1ZS8;1ZSD;1ZT4;1ZVS;2A83;2AK4;2AV1;2AV7;2AXF;2AXG;2BCK;2BNQ;2BNR;2BSR;2BSS;2BST;2BVO;2BVP;2BVQ;2C7U;2CII;2CIK;2CLR;2D31;2D4D;2D4F;2DYP;2E8D;2ESV;2F53;2F54;2F74;2F8O;2FYY;2FZ3;2GIT;2GJ6;2GT9;2GTW;2GTZ;2GUO;2H26;2H6P;2HJK;2HJL;2HLA;2HN7;2J8U;2JCC;2NW3;2NX5;2P5E;2P5W;2PO6;2PYE;2RFX;2UWE;2V2W;2V2X;2VB5;2VLJ;2VLK;2VLL;2VLR;2X4N;2X4O;2X4P;2X4Q;2X4R;2X4S;2X4T;2X4U;2X70;2X89;2XKS;2XKU;2XPG;2YPK;2YPL;2YXF;2Z9T;3AM8;3B3I;3B6S;3BGM;3BH8;3BH9;3BHB;3BO8;3BP4;3BP7;3BVN;3BW9;3BWA;3BXN;3BZE;3BZF;3C9N;3CDG;3CII;3CIQ;3CZF;3D18;3D25;3D2U;3D39;3D3V;3DBX;3DHJ;3DHM;3DTX;3DX6;3DX7;3DX8;3DXA;3EKC;3FFC;3FQN;3FQR;3FQT;3FQU;3FQW;3FQX;3FT2;3FT3;3FT4;3GIV;3GJF;3GSN;3GSO;3GSQ;3GSR;3GSU;3GSV;3GSW;3GSX;3H7B;3H9H;3H9S;3HAE;3HCV;3HG1;3HLA;3HPJ;3HUJ;3I6G;3I6K;3I6L;3IB4;3IXA;3JTS;3KLA;3KPL;3KPM;3KPN;3KPO;3KPP;3KPQ;3KPR;3KPS;3KWW;3KXF;3KYN;3KYO;3L3D;3L3G;3L3I;3L3J;3L3K;3LKN;3LKO;3LKP;3LKQ;3LKR;3LKS;3LN4;3LN5;3LOW;3LOZ;3LV3;3M17;3M1B;3MGO;3MGT;3MR9;3MRB;3MRC;3MRD;3MRE;3MRF;3MRG;3MRH;3MRI;3MRJ;3MRK;3MRL;3MRM;3MRN;3MRO;3MRP;3MRQ;3MRR;3MV7;3MV8;3MV9;3MYJ;3MYZ;3MZT;3NA4;3NFN;3O3A;3O3B;3O3D;3O3E;3O4L;3OV6;3OX8;3OXR;3OXS;3PWJ;3PWL;3PWN;3PWP;3QDA;3QDG;3QDJ;3QDM;3QEQ;3QFD;3QFJ;3QZW;3REW;3RL1;3RL2;3RWJ;3S6C;3SDX;3SJV;3SKM;3SKO;3SPV;3T8X;3TID;3TIE;3TLR;3TM6;3TO2;3TZV;3U0P;3UPR;3UTQ;3UTS;3UTT;3V5D;3V5H;3V5K;3VCL;3VFM;3VFN;3VFO;3VFP;3VFR;3VFS;3VFT;3VFU;3VFV;3VFW;3VH8;3VRI;3VRJ;3VWJ;3VWK;3VXM;3VXN;3VXO;3VXP;3VXR;3VXS;3VXU;3W0W;3W39;3WL9;3WLB;3WUW;3X11;3X12;3X13;3X14;4E0K;4E0L;4E5X;4EN3;4EUP;4F7M;4F7P;4F7T;4FTV;4FXL;4G8G;4G8I;4G9D;4G9F;4GKN;4GKS;4GUP;4HKJ;4HWZ;4HX1;4I48;4I4W;4JFD;4JFE;4JFF;4JFO;4JFP;4JFQ;4JQV;4JQX;4JRX;4JRY;4K71;4K7F;4KDT;4L29;4L3C;4L3E;4L4T;4L4V;4LCW;4LCY;4LHU;4LNR;4M8V;4MJ5;4MJ6;4MJI;4MNQ;4N0F;4N0U;4N8V;4NNX;4NNY;4NO0;4NO2;4NO3;4NO5;4NQC;4NQD;4NQE;4NQV;4NQX;4NT6;4O2C;4O2E;4O2F;4ONO;4PJ5;4PJ7;4PJ8;4PJ9;4PJA;4PJB;4PJC;4PJD;4PJE;4PJF;4PJG;4PJH;4PJI;4PJX;4PR5;4PRA;4PRB;4PRD;4PRE;4PRH;4PRI;4PRN;4PRP;4QOK;4QRP;4QRQ;4QRR;4QRS;4QRT;4QRU;4R9H;4RA3;4RAH;4RMQ;4RMR;4RMS;4RMT;4RMU;4RMV;4RMW;4U1H;4U1I;4U1J;4U1K;4U1L;4U1M;4U1N;4U1S;4U6X;4U6Y;4UQ2;4UQ3;4WC8;4WDI;4WJ5;4WO4;4WU5;4WU7;4WUU;4WW2;4WWK;4X0S;4X6C;4X6D;4X6E;4X6F;4XXC;4Z76;4Z77;4Z78;5B38;5B39;5BJT;5BRZ;5BS0;5BXF;5C07;5C08;5C09;5C0A;5C0B;5C0C;5C0D;5C0E;5C0F;5C0G;5C0I;5C0J;5C9J;5CFH;5CKA;5CKG;5CS7;5CSB;5CSG;5D2L;5D2N;5D5M;5D7I;5D7J;5D7L;5D9S;5DDH;5DEF;5DEG;5E00;5E6I;5E9D;5ENW;5EO0;5EO1;5EOT;5EU3;5EU4;5EU5;5EU6;5EUO;5F1I;5F7D;5F9J;5FA3;5FA4;5FDW;5GR7;5GRD;5GRG;5GSB;5GSD;5GSR;5GSV;5GSX;5HGA;5HGB;5HGD;5HGH;5HHM;5HHN;5HHO;5HHP;5HHQ;5HYJ;5IB1;5IB2;5IB3;5IB4;5IB5;5IEH;5IEK;5IM7;5INC;5IND;5IRO;5ISZ;5IUE;5J1A;5JHD;5JZI;5KNM;5L2J;5L2K;5MEN;5MEO;5MEP;5MEQ;5MER;5N1Y;5N6B;5NHT;5NME;5NMF;5NMG;5NMH;5NMK;5NQ1;5NQ3;5NQK;5OPI;5SWQ;5T6W;5T6X;5T6Y;5T6Z;5T70;5TEZ;5TRZ;5TS1;5TXS;5U16;5U17;5U1R;5U2V;5U6Q;5U72;5U98;5V5L;5V5M;5VGD;5VGE;5VUD;5VUE;5VUF;5VVP;5VWD;5VWF;5VWH;5VWJ;5VZ5;5W1V;5W1W;5W67;5W69;5W6A;5WER;5WHK;5WJL;5WJN;5WKE;5WKF;5WKG;5WKH;5WKI;5WL1;5WMN;5WMO;5WMP;5WMQ;5WMR;5WSH;5WWI;5WWJ;5WWU;5WXC;5WXD;5XOS;5XOT;5XOV;5YXN;5YXU;6AEE;6AM5;6AMT;6AMU;6APN;6AT5;6AT9;6AVF;6AVG;6BJ2;6BJ3;6BJ8;6BXP;6BXQ;6C09;6C15;6C97;6C98;6C99;6CUG;6D29;6D2B;6D2R;6D2T;6D64;6D78;6DKP;6EI2;6ENY;6EQA;6EQB;6EWA;6EWC;6EWO;6FGB;6G3J;6G3K;6GGM;6GH1;6GH4;6GHN;6GK3;6GL1;6ID4;6IEX;6ILM;6J1V;6J1W;6J29;6J2A;6J2E;6J2G;6J2H;6J2I;6J2J;6JOZ;6JP3;6JTN;6JTO;6JTP;6K60;6K7T;6LA6;6LA7;6M1B;6M24;6M2J;6M2K;6MPP;6MT3;6MT4;6MT5;6MT6;6MTL;6MTM;6MWR;6NCA;6NHA;6NPR;6NUX;6O4Y;6O4Z;6O51;6O53;6O9B;6O9C;6OPD;6P23;6P27;6P2C;6P2F;6P2S;6P64;6PA1;6PAG;6PBH;6PTB;6PTE;6PUC;6PUD;6PUE;6PUF;6PUG;6PUH;6PUI;6PUJ;6PUK;6PUL;6PUM;6PVC;6PVD;6PYJ;6PYL;6PYV;6PYW;6PZ5;6Q3K;6Q3S;6QIO;6QIP;6R2L;6RP9;6RPA;6RPB;6RSY;6SS7;6SS8;6SS9;6SSA;6TDO;6TDP;6TDQ;6TDR;6TDS;6TMO;6TRN;6TRO;6UJ7;6UJ8;6UJ9;6UJO;6UJQ;6UK2;6UK4;6ULI;6ULK;6ULN;6ULR;6UON;6UZ1;6UZM;6UZN;6UZO;6UZP;6UZQ;6UZS;6V2O;6V2P;6V2Q;6V3J;6V7Y;6V7Z;6V80;6VB0;6VB1;6VB2;6VB3;6VB4;6VB5;6VB6;6VB7;6VIU;6VM7;6VM8;6VM9;6VMA;6VMC;6VMX;6VPZ;6VQ2;6VQD;6VQE;6VQO;6VQY;6VQZ;6VR1;6VR5;6VRM;6VRN;6W51;6W9U;6W9V;6WNA;6WOL;6WZY;6X00;6XQA;6XQP;6Y26;6Y27;6Y28;6Y29;6Y2A;6Y2B;6Z9V;6Z9W;6Z9X;6ZKW;6ZKX;6ZKY;6ZKZ;7AFV;7ALO;7B5F;7BBG;7BH8;7C9V;7CIQ;7CIR;7CIS;7DUU;7DYN;7DZM;7DZN;7EDO;7EJL;7EJM;7EJN;7EU2;7F4W;7JWI;7JYU;7JYV;7JYW;7JYX;7K80;7K81;7KGO;7KGP;7KGQ;7KGR;7KGS;7KGT;7KOZ;7KP0;7KP1;7L1B;7L1C;7L1D;7LFZ;7LG0;7LG2;7LG3;7LGD;7LGT;7LLI;7LLJ;7M8S;7M8T;7M8U;7MJ6;7MJ7;7MJ8;7MJ9;7MJA;7MKB;7MLE;7MX4;7MXF;7MXH;7N1A;7N1B;7N1E;7N1F;7N6D;7N6E;7NDQ;7NDT;7NDU;7NUI;7P3D;7P3E;7RM4;7RRG;7RTD;7RTR;7S8Q;7S8R;7S8S;7WKJ; |
![]() |
Function | Component of the class I major histocompatibility complex (MHC). |
|
Interaction ID | 1114 |
| Target type | Protein | |
| Target unique ID | P61769 | |
| Activity | 36.7 nM | |
| Binding Conditions/Buffer | Ammonium bicarbonate buffer (50 mM, pH 8.5) containing 500 mM NaCl |
|
| Assay | Characterization of selected B2M-binding aptamers |
|
| PubMed ID | 32631049 |
| Aptamer ID | Aptamer chemistry | Sequence | Similarity |
|---|---|---|---|
| Apta_622 | DNA | AAGCTTTTTTGACTGACTGCAGCGATTCTTGATCGCCACGGTCTGGAAAAAGAG | |
| Apta_510 | DNA | TGTAATTTGTCTGCAGCGGTTCTTGATCGCTGACACCATATTATGAAGA | |
| Apta_348 | DNA | ACTTGCTCTGATGCGACAACCTTTTGCCCAGATAGTAAGT | |
| Apta_1096 | DNA | CTTCTTCGTTAGAAGCCTGTCAATGGCCAGGGGGGAGGGG | |
| Apta_240 | DNA | TTTTTAATTAAAGCTCGCCATCAAATAGCTTT | |
| Apta_503 | DNA | ACTTTTGAATGTGGCAACAAATTCGACAGG | |
| Apta_694 | DNA | ACTCACTATGGAAGAGATGGCGACATCTCTTCTCCGAGCCGGTCGAAATAGTGAGT | |
| Apta_987 | DNA | GTACTGTCAATTGGAAGTGGTGTTACGTTGTGTAGTCAAATCAGTGC | |
| Apta_274 | DNA | GATACTGAGCATCGTACATGATCCCGCAACGGGCAGTATT | |
| Apta_476 | DNA | CCTATCTTATTCGTTGCGGACTCCCCGGTCGGTATGTATG | |
| Apta_928 | DNA | GATTGAGTAGATAGTGGTTCTGTACGTAGTGAAAGAGTGG | |
| Apta_1270 | DNA | GTATATCAAGCATCGCGTGTTTACACATGCGAGAGGTGAA | |
| Apta_340 | DNA | TACTCAGGGCACTGCAAGCAATTGTGGTCCCAATGGGCTGAGTA | |
| Apta_411 | DNA | AGACGTAAGTTAATTGGACTTGGTCGTGTGCGGCACAGCGATTGAAAT | |
| Apta_239 | DNA | CCCAGATTACTGTGGAGTGGTTGTCTGCGAATCCTTCGTCCACCCAATAG | |
| Apta_973 | DNA | TATGTAATGTTGACGTAATTTATCTCTGTGAGAATAAGCAGGTGGTATCC | |
| Apta_363 | DNA | ATTGACCGCTGTGTGACGCAACACTCAAT | |
| Apta_1149 | DNA | ATCATGGTGGGTATCGGCACTCGTTGGTTGAT | |
| Apta_752 | DNA | GCTATCTTATGGAAATTTCGTGTAGGGTTTGGTGTGGCGGGGCTA | |
| Apta_1280 | DNA | TCATATCCTTCTTGGTATCATTGCGTCATTTAGTCATTCATGTTATTCCCGAGGG |