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ADMET 与药代 9
admetSAR3.0
置顶1吸收、分布、代谢、排泄和毒性(ADMET)性质在药物开发以及农药、食品添加剂和化妆品等化学品风险评估中起着至关重要的作用。admetSAR3.0 是广泛使用的综合性ADMET评估工具 admetSAR2.0 的增强版本。admetSAR3.0 支持搜索、预测和优化等功能。通过改进的功能模块、终点数据、预测模型以及用户友好的网页界面,admetSAR3.0 有望成为药物开发和化学品风险评估中更加有价值和强大的工具。
结合传统机器学习和深度学习,预测化合物的内在清除率,并提供解释性分析。
基于分子结构相似性预测 ADMET 性质,支持输入多条 SMILES 进行批量分析。
面向人、犬、猴、大鼠和小鼠,预测静脉给药后的多项药代动力学参数,支持跨物种早期评价。
利用多模态深度学习,从分子结构预测人体口服给药后的八项药代动力学参数,并展示有助于解释预测的分子亚结构。
DBPP-Predictor为预测化学药物相似性提供了有价值的工具,有助于识别合适的候选药物以供进一步开发。
欢迎使用我们的先进平台,该平台结合了多任务Unimol模型和RDKit工具,通过SMILES字符串预测药物的可成药性,并对ADMET性质进行全面分析。
用于评估化学品ADMET性质的全面资源与免费工具
在优化先导化合物时考虑ADMET性质。
药物代谢 6
预测 CYP、UGT 和 AOX 酶介导的代谢位点,提供原子级评分、底物分类和候选代谢物生成。
利用分子几何与化学键特征,预测细胞色素 P450 介导的药物代谢位点,并展示原子级预测结果。
基于正例—未标注学习和多任务建模,预测化合物诱导细胞色素 P450 酶的可能性,并辅助分析关键分子结构。
预测化合物是否为 UDP-葡萄糖醛酸转移酶(UGT)底物,以及可能发生葡萄糖醛酸化的代谢位点,并提供交互式原子标注。
集成代谢物相似性检索、基于图神经网络的药物代谢位点预测和基于 Transformer 的潜在代谢产物预测,支持单分子及批量分析。
用于人类醛氧化酶代谢预测的网页服务器
毒性与安全性 3
从分子结构预测肝毒性,并提供靶点、分子事件和暴露相关分析。
短肽毒性筛查与证据支持的靶标、效应类别排序平台;公开的 Lite 模式支持序列输入、候选结果查看与导出。
结合计算靶标谱和机器学习模型,预测化合物的潜在内分泌干扰活性,辅助内分泌干扰物筛查及相关研究。
靶点与疾病 7
针对结核分枝杆菌开展多任务化合物活性预测,辅助抗结核候选分子筛选。
针对黑色素相关靶点开展分子虚拟筛选,并提供可追溯的靶点与研究证据。
面向疾病特异性的治疗靶点组合,提供证据浏览、靶点伙伴预测与组合关系解释。
预测化合物与病毒蛋白的相互作用,并支持对候选化合物库进行筛选和排序。
结合组学数据与多尺度网络,预测癌症相关的治疗靶点组合并提供机制解释。
预测化合物对核受体的配体活性,先筛查结合可能性,再对活性端点进行功能分类。
NetInfer 是一个基于网络推理方法的预测网页服务器,可用于预测靶点、治疗作用和不良反应。与我们之前开发的独立版本相比,该网页服务器提供了更为友好的用户界面。通过该服务器,用户可以在几个简单步骤中,轻松预测感兴趣小分子可能对应的靶标蛋白、microRNA、通路、解剖治疗化学(ATC)分类代码或药物不良事件(ADE)。预测结果有助于发现用户提交分子的潜在治疗作用和不良反应,并帮助揭示其分子作用机制。
多肽与生物大分子 4
面向肽序列的多端点预测平台,支持单序列及批量输入,并提供结果导出。
直接从氨基酸序列预测蛋白质溶解度、热稳定性和毒性,无需输入三维结构。
结合序列、化学修饰和双链结构信息,预测化学修饰 siRNA 的基因敲低效率,辅助候选序列筛选。
Bilingua-DPP-IV 是一个利用先进的机器学习模型来预测肽序列是否具有二肽基肽酶IV (DPP-IV) 抑制活性的在线工具。DPP-IV 抑制剂在治疗2型糖尿病等代谢性疾病方面展现出重要潜力。本工具旨在为研究人员提供一个快速、便捷的筛选潜在DPP-IV抑制肽的平台。我们采用了双模态融合深度学习模型,结合序列信息和分子特性进行预测,以期达到高准确性和可靠性。
专题数据库 4
整合文献和数据库中的适配体及相关信息,支持适配体检索与研究。
多功能肽数据库,整合肽序列、活性、来源及文献证据,支持检索和分析。
提供人和小鼠转录本翻译起始位点的候选注释与检索功能。
MetaADEDB 是我们开发的一个在线数据库,用于整合药物不良事件(ADEs)的全面信息。
分子设计与合成 2
预测分子的合成难度,并提供可选的 Retro* 逆合成路径规划,辅助评估候选结构的合成可及性。
集成 Fluor-pred 染料光物理性质预测与 Fluor-opt 近红外染料结构优化,辅助荧光分子的设计与筛选。
代码资源 3
本代码库包含论文《CLaSP:一个用于全面评估药物相似性的对比学习引导潜在评分平台》的实现。
Bilingua-DPP-IV 是一个利用先进的机器学习模型来预测肽序列是否具有二肽基肽酶IV (DPP-IV) 抑制活性的在线工具。本代码项目是Bilingua-DPP-IV的训练、测试代码。
ERRalpha-Predictor
其他研究工具 1
基于 Detectron2 实例分割的微粒显微图像与视频分析平台,可识别晶体、液滴、微球等颗粒,统计形态指标、监测异常,并导出标注结果和报告。
已停止维护 7
MetaADEDB2(旧入口)
已停止维护原 /metaadedb2 反向代理入口目前返回 404。
CYP-Predictor
已停止维护历史平台,原反向代理入口目前不可访问。
NetCorecSys
已停止维护历史平台,原反向代理入口目前不可访问。
SMINBR
已停止维护历史平台,原反向代理入口目前不可访问。
DMC
已停止维护历史平台,原反向代理入口目前不可访问。
admetSAR1.0
已停止维护admetSAR 提供最新且最全面的人工整理数据,涵盖具有已知吸收、分布、代谢、排泄和毒性(ADMET)特征的各类化学物质。admetSAR 构建了一个用户友好的界面,支持通过名称、CAS 注册号以及相似性搜索方式查找ADMET性质信息。此外,admetSAR 还可借助我们最新开发的基于化学信息学的工具箱 ADMET-Simulator,预测约50个ADMET终点,该工具整合了高质量且具备良好预测能力的QSAR模型。admetSAR 将为药物候选物和环境化学物质的计算筛选与ADMET特征分析提供有力支持。
SOM-Predictor
已停止维护用于类药化合物代谢位点的计算预测网页服务器